Totalomics Solutions

TotalOmics

목차

Tigriopus californicus(Tidepool copepod)

  

동물계(Animalia)
 절지동물문(Arthropoda)
  소악강(Maxillopoda)
   갈고리노벌레목(Harpacticoida)
    장수노벌레과(Harpacticidae)

 

 

연구목적
     Tigriopus californicus는 이소적 유전자 종분화와 생식적 격리를 야기하는 유전자 변이의 성질을 면밀히 연구하는 데 유용하다.
연구내용
      2007년 Tigriopus californicus의 mtDNA 진화를 더 잘 이해하기 위해 mtDNA 유전체를 완벽히 해독하고, 이미 해독된 티그리오푸스 자포니쿠스의 mtDNA의 유전체 염기서열을 비교했다.(Burton RS, et al., Three divergent mitochondrial genomes from California populations of the copepod Tigriopus californicus., Gene. 2007 Nov 15;403(1-2):53-9)
 
 
       2009년 6월 미세 규모에서의 Tigriopus californicu 계통생물지리학 연구로 개체군 분기의 진화적 패턴을 밝힌 논문이다. (Willett CS, Ladner JT., “Investigations of fine-scale phylogeography in Tigriopus californicus reveal historical patterns of population divergence.” BMC Evol Biol. 2009 Jun 23;9:139.)
 
       2010년 03월 Ellison CK, Burton RS의 논문에 따르면 유기체 적합성은 핵과 미토콘드리아 유전체의 기능적 통합을 요구한다. 혈통내에서 구조적, 조절적 요소는 공진화 했고 몇가지 연구를 통해 Tigriopus californicu의 이종간의 교배(잡종)이 미토콘드리아의 핵의 상호작용을 방해한다는 것이 밝혀졌다. 미토콘드리아의 RNA 중합효소는(mtRPOL)는 미토콘드리아의 DNA 복제와 전사, mtRPOL와의 상호작용에 중요한 역할을 하며 mtDNA의 조절부위와 공진화한다는 내용이다.(Ellison CK, Burton RS.., “Cytonuclear conflict in interpopulation hybrids: the role of RNA polymerase in mtDNA transcription and replication.”J Evol Biol.2010 Mar;23(3):528-38)
       
       2010년 4월 열 스트레스 환경하에서 온도 적응, 열 스트레스 내성 관련 연구가 진행되었다.(Willett CS. ., "POTENTIAL FITNESS TRADE-OFFS FOR THERMAL TOLERANCE IN THE INTERTIDAL COPEPOD TIGRIOPUS CALIFORNICUS.". Evolution.2010 Apr 14.)
 
Genome Projects
진행현황 • 유전체 해독수준 : 미토콘드리아 유전체 해독                                         
연구기관 •  NCBI Genome Project (NCBI, 미국 스크립트 해양연구소 해양생물학 연구관)
 
데이터 현황
           DNA 서열 - 749
           EST 서열 - 4,751
           단백질 서열 - 770
           유전자 서열- 13         
 
참고
       •  종분화란? 위키백과에서 보기
       •  한국 담수 요각류 데이타베이스 및 담수산 요각류의 연구사 ⇒  http://cms.daegu.ac.kr/copepoda/
 •  요각류란?
   요각류는 칼라누스류(긴노요각목, 가장 흔하게 볼 수 있는 종), 사이클로프스류(검물벼룩목), 하팍티쿠스류(갈고리노벌레목, 대부분 저서성이며 부유생활을 하는 것은 수가 많지 않다. 크기가 가장 작고 머리, 가슴, 배의 구분이 다른 종류처럼 뚜렷하지 않고 몸체가 가늘다)로 나뉜다. 요각류는 촉각으로 물의 움직임이나 화학물질의 냄새를 감지할 수 있고 머리의 입부분에는 먹이입자를 걸러 먹을 수 있는 여과기가 잘 발달하였으며, 가슴의 각 마디에는 헤엄칠 때 사용하는 유영지가 달려있다. 배에는 생식공 및 항문이 자리잡고 있다.