Totalomics Solutions

TotalOmics


목차

 
Cucumis sativus ( Cucumber, 오이 )

    식물계 ( Plantae )
        박 목 ( Cucurbitales   )
            박 과 ( Cucurbitaceae ) 

Cucumis sativus.jpg
< 출처:http://en.wikipedia.org >
대상소개 

오이는 멜론 호박과 같은 여러 가지 경제적으로 중요한 야채이다.
세계 온대 열대지역에 고루 분포 하고 있으며, 작은 게놈 사이즈로 유전자 연구에 모델 식물로 쓰이고 있다.

게놈프로젝트 내용 
  • 진행현황 • 유전체 해독수준 : 초벌 유전체
  • 연구내용 • 유전체 크기 : 225.8Mb

                  • 염색체 수 : 7쌍                   

  • 연구기관 : School of Biological Sciences, University of Hong Kong,


데이터 현황
  • DNA 서열 – 2,779
  • EST 서열 – 8,146
  • 유전자 서열 – 197
  • 단백질 서열 – 1,478
  • 유전체 - 12.5배 유전체 해독(12.5X)


 Genome Projects 관련 논문

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22240004
" Identification of differentially expressed genes in cucumber (Cucumis sativus L.) root under waterlogging stress by digital gene expression profile." http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22104164
" Occidental diffusion of cucumber (Cucumis sativus) 500-1300 CE: two routes to Europe"


  참고 자료
http://en.wikipedia.org/wiki/Cucumis_sativus